今彩539的總球數是39顆，號碼01-39，而且在39個號碼裡選擇5個號碼；開獎時會開出5個號碼，成其為「獎號」，539立柱若是選擇的號碼和獎號有相同那就是中獎了，而且依據相同的號碼的數量，獎項有分為獎金最低的肆獎到獎金最高的頭獎。

今彩539最常見的玩法：

二星、三星、四星，幾星就代表幾個號碼。

二星 → 在39個號號中選擇2個號碼，若是2個號碼皆開出，即中獎。
三星 → 在39個號號中選擇3個號碼，若是3個號碼皆開出，即中獎。
四星 → 在39個號號中選擇4個號碼，若是4個號碼皆開出，即中獎。

今彩539玩法的話，那就不得不提到「連碰」，六合彩玩法連碰的意思是假如你只選了四個號碼，並不約束只能玩四星，而是二星三星四星通通都可以下註一起玩。例如：選四個號碼，並同時下二三四星，那麼二星的組數有6組；三星的組數有4組；四星有1組，所以一共下注11組。

本金的話則是會跟著你所選的號碼數量和挑選的玩法而有所不同。例如：選四個號碼，只下註二星，並設一組二星80元，而二星組數有6組，本金便是80×6=480元；若下註三星四星，並設一組三星70元、一組四星60元，而三星4組加四星1組共五組，本金便是(70×4)+(60×1)=340元；若是二三四星全下共11組，本金便是(80×6)+(70×4)+(60×1)=820元。

今彩539獎金，同理本金，因應所選的號碼數量和挑選的玩法而不同。例如：選四個號碼，只下二星，並設一組二星獎金5300元，二星組數有6組，獎金便是5300×6=31800元；獎金核算方式同本金，只是乘的錢從本金變為獎金罷了。